Python for bioinformatics

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Responsável: Vítor Vieira                                               

Biografia: Vítor Vieira tirou Ciências Biomédicas em Aveiro e depois fez mestrado em Bioinformática em Braga. Neste momento é aluno de doutoramento em Engenharia Biomédica.

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Programa do workshop: 

 

Biopython é um projecto open-source apoiado pela Open Bioinformatics Foundation (organização sem fins lucrativos,que apoia código open-source na área de bioinformática). Trata-se de uma biblioteca de métodos em Python para biologia molecular/genética, sendo largamente usado em diversas áreas científicas.

 

Neste workshop será feita uma breve introdução ao Python, abordando alguns princípios básicos de programação em Python. Posteriormente será feita uma introdução ao biopython, passando por exercícios práticos e no final será elaborado um pequeno programa para análise de sequências biológicas. 

 

Requisitos:

- Computador pessoal,

- Python 2.7 instalado (https://conda.io/miniconda.html),

- BioPython instalado (http://biopython.org/wiki/Download).

 

Caso tenham dificuldades nas instalações aconselhamos que cheguem 30 minutos mais cedo.